氫氣發生器的制氫的原理有以下幾種。

1、純水電解制氫　把滿足要求的電解水（電阻率大于1MΩ/cm，電子或剖析職業用的去離子水或二次蒸餾水皆可）送入電解槽陽極室，通電后水便立刻在陽極分解：2H2O=4H++ 2O-2，分解成的負氧離子（O-2），隨即在陽極放出電子，形成氧氣（O2），從陽極室排出，帶著部份水進入水槽，水可循環使用，氧氣從水槽上蓋小孔放入大氣。氫質子以水合離子（H+?XH2O）的方式，在電場力的效果下，通過SPE離子膜，抵達陰極吸收電子形成氫氣，從陰極室排出后，進入氣水分離器，在此除掉從電解槽帶著出的大部分水份，含微量水份的氫氣再經干燥器吸濕后，純度便到達99.999%以上。　

2、堿液電解制氫　作業原理是傳統隔閡堿液電解法。電解槽內的導電介質為氫氧化鉀水溶液，南北極室的分隔物為航天電解設備用隔閡，與端板合為一體的耐蝕、傳質良好的格柵電極等組成電解槽。向南北極施加直流電后，水分子在電解槽的南北極立刻發生電化學反應，在陽極產生氧氣，在陰極產生氫氣。反應式如下：陽極： 2OH--2e → H2O+1/2O2↑ 陰 極： 2H2O +2e →2OH- +H2↑ 總反應式： 2H2O → 2 H2↑ +O2↑ 本儀器對壓控、過壓維護、流量顯示、流量追蹤等均實行自動控制；使輸出氫氣能在恒壓下，依據氣相色譜儀用氫氣量，完成全自動調節